Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
IFITM3Q01628 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms