Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VBP1P61758 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VBP1P61758 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VBP1P61758 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VBP1P61758 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VBP1P61758 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VBP1P61758 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VBP1P61758 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VBP1P61758 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VBP1P61758 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VBP1P61758 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VBP1P61758 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
VBP1P61758 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
VBP1P61758 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
VBP1P61758 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VBP1P61758 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VBP1P61758 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VBP1P61758 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VBP1P61758 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VBP1P61758 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VBP1P61758 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VBP1P61758 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VBP1P61758 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VBP1P61758 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VBP1P61758 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VBP1P61758 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VBP1P61758 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VBP1P61758 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VBP1P61758 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VBP1P61758 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VBP1P61758 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VBP1P61758 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VBP1P61758 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VBP1P61758 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VBP1P61758 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VBP1P61758 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VBP1P61758 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VBP1P61758 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VBP1P61758 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VBP1P61758 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VBP1P61758 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
VBP1P61758 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VBP1P61758 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VBP1P61758 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VBP1P61758 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VBP1P61758 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VBP1P61758 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VBP1P61758 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VBP1P61758 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VBP1P61758 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VBP1P61758 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VBP1P61758 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VBP1P61758 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VBP1P61758 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VBP1P61758 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VBP1P61758 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VBP1P61758 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VBP1P61758 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VBP1P61758 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
VBP1P61758 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VBP1P61758 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VBP1P61758 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VBP1P61758 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VBP1P61758 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VBP1P61758 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VBP1P61758 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VBP1P61758 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VBP1P61758 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VBP1P61758 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VBP1P61758 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VBP1P61758 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VBP1P61758 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VBP1P61758 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VBP1P61758 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VBP1P61758 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VBP1P61758 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VBP1P61758 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VBP1P61758 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VBP1P61758 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VBP1P61758 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VBP1P61758 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VBP1P61758 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VBP1P61758 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VBP1P61758 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VBP1P61758 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
VBP1P61758 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VBP1P61758 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VBP1P61758 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VBP1P61758 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VBP1P61758 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VBP1P61758 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VBP1P61758 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VBP1P61758 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VBP1P61758 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VBP1P61758 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
VBP1P61758 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VBP1P61758 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VBP1P61758 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VBP1P61758 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VBP1P61758 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms