Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms