Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms