Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms