Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD53P19397 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD53P19397 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD53P19397 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD53P19397 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD53P19397 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD53P19397 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD53P19397 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD53P19397 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD53P19397 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD53P19397 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD53P19397 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD53P19397 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD53P19397 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD53P19397 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CD53P19397 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD53P19397 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD53P19397 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD53P19397 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD53P19397 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CD53P19397 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CD53P19397 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CD53P19397 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CD53P19397 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD53P19397 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD53P19397 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CD53P19397 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD53P19397 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CD53P19397 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD53P19397 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD53P19397 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD53P19397 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD53P19397 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CD53P19397 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD53P19397 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD53P19397 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD53P19397 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD53P19397 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD53P19397 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD53P19397 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD53P19397 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD53P19397 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD53P19397 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD53P19397 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD53P19397 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD53P19397 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD53P19397 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD53P19397 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD53P19397 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD53P19397 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD53P19397 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD53P19397 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD53P19397 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD53P19397 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD53P19397 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CD53P19397 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD53P19397 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD53P19397 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD53P19397 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD53P19397 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD53P19397 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD53P19397 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD53P19397 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD53P19397 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD53P19397 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD53P19397 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD53P19397 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD53P19397 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD53P19397 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD53P19397 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD53P19397 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD53P19397 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD53P19397 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD53P19397 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD53P19397 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD53P19397 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD53P19397 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD53P19397 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD53P19397 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD53P19397 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD53P19397 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD53P19397 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD53P19397 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD53P19397 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD53P19397 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD53P19397 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD53P19397 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD53P19397 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD53P19397 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD53P19397 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD53P19397 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD53P19397 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD53P19397 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD53P19397 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD53P19397 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD53P19397 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD53P19397 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD53P19397 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD53P19397 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD53P19397 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms