Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms