Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms