Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M3

SFTA3, Surfactant-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3P0C7M3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms