Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRCP08575 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
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