Protein–RNA interactions for Protein: O95202

LETM1, Mitochondrial proton/calcium exchanger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 739 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM1O95202 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LETM1O95202 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LETM1O95202 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LETM1O95202 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LETM1O95202 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LETM1O95202 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LETM1O95202 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LETM1O95202 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LETM1O95202 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LETM1O95202 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LETM1O95202 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LETM1O95202 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LETM1O95202 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LETM1O95202 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LETM1O95202 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LETM1O95202 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LETM1O95202 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LETM1O95202 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LETM1O95202 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LETM1O95202 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LETM1O95202 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LETM1O95202 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LETM1O95202 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LETM1O95202 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LETM1O95202 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LETM1O95202 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LETM1O95202 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LETM1O95202 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LETM1O95202 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LETM1O95202 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LETM1O95202 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LETM1O95202 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LETM1O95202 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LETM1O95202 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LETM1O95202 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LETM1O95202 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LETM1O95202 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LETM1O95202 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LETM1O95202 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LETM1O95202 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LETM1O95202 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LETM1O95202 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LETM1O95202 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LETM1O95202 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LETM1O95202 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LETM1O95202 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LETM1O95202 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LETM1O95202 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LETM1O95202 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LETM1O95202 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LETM1O95202 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LETM1O95202 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LETM1O95202 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LETM1O95202 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LETM1O95202 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LETM1O95202 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LETM1O95202 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LETM1O95202 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LETM1O95202 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LETM1O95202 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LETM1O95202 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LETM1O95202 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LETM1O95202 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LETM1O95202 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LETM1O95202 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LETM1O95202 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LETM1O95202 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LETM1O95202 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LETM1O95202 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LETM1O95202 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LETM1O95202 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LETM1O95202 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LETM1O95202 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LETM1O95202 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LETM1O95202 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LETM1O95202 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LETM1O95202 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LETM1O95202 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LETM1O95202 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LETM1O95202 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LETM1O95202 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LETM1O95202 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LETM1O95202 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LETM1O95202 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LETM1O95202 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LETM1O95202 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LETM1O95202 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LETM1O95202 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LETM1O95202 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LETM1O95202 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LETM1O95202 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LETM1O95202 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LETM1O95202 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LETM1O95202 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LETM1O95202 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LETM1O95202 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LETM1O95202 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LETM1O95202 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LETM1O95202 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LETM1O95202 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms