Protein–RNA interactions for Protein: O00512

BCL9, B-cell CLL/lymphoma 9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL9O00512 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BCL9O00512 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BCL9O00512 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BCL9O00512 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BCL9O00512 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BCL9O00512 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BCL9O00512 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BCL9O00512 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BCL9O00512 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BCL9O00512 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BCL9O00512 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BCL9O00512 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BCL9O00512 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BCL9O00512 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BCL9O00512 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BCL9O00512 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BCL9O00512 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BCL9O00512 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BCL9O00512 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BCL9O00512 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BCL9O00512 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BCL9O00512 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BCL9O00512 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BCL9O00512 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
BCL9O00512 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BCL9O00512 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BCL9O00512 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
BCL9O00512 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
BCL9O00512 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BCL9O00512 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BCL9O00512 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BCL9O00512 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BCL9O00512 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BCL9O00512 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BCL9O00512 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BCL9O00512 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BCL9O00512 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BCL9O00512 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BCL9O00512 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
BCL9O00512 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
BCL9O00512 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BCL9O00512 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BCL9O00512 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BCL9O00512 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BCL9O00512 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BCL9O00512 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BCL9O00512 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BCL9O00512 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BCL9O00512 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BCL9O00512 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BCL9O00512 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BCL9O00512 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BCL9O00512 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BCL9O00512 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
BCL9O00512 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BCL9O00512 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BCL9O00512 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BCL9O00512 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BCL9O00512 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BCL9O00512 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BCL9O00512 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BCL9O00512 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BCL9O00512 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BCL9O00512 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BCL9O00512 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
BCL9O00512 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BCL9O00512 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
BCL9O00512 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BCL9O00512 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BCL9O00512 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BCL9O00512 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BCL9O00512 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BCL9O00512 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BCL9O00512 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BCL9O00512 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BCL9O00512 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BCL9O00512 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
BCL9O00512 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BCL9O00512 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BCL9O00512 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BCL9O00512 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BCL9O00512 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BCL9O00512 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BCL9O00512 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BCL9O00512 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BCL9O00512 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BCL9O00512 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BCL9O00512 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BCL9O00512 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BCL9O00512 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BCL9O00512 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BCL9O00512 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BCL9O00512 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BCL9O00512 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BCL9O00512 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BCL9O00512 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BCL9O00512 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BCL9O00512 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BCL9O00512 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BCL9O00512 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms