Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM247A6NEH6 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM247A6NEH6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM247A6NEH6 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM247A6NEH6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM247A6NEH6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM247A6NEH6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms