Protein–RNA interactions for Protein: A6NDU8

C5orf51, UPF0600 protein C5orf51, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf51A6NDU8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms