Protein–RNA interactions for Protein: A6NDG6

PGP, Glycerol-3-phosphate phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPA6NDG6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGPA6NDG6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGPA6NDG6 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGPA6NDG6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGPA6NDG6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGPA6NDG6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGPA6NDG6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGPA6NDG6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms