Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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