Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDGFL3Q9Y3E1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms