Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAB39Q9Y376 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms