Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX12Q9UMY4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms