Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms