Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDP1Q9P0J1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDP1Q9P0J1 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDP1Q9P0J1 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDP1Q9P0J1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PDP1Q9P0J1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDP1Q9P0J1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDP1Q9P0J1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDP1Q9P0J1 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDP1Q9P0J1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PDP1Q9P0J1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDP1Q9P0J1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDP1Q9P0J1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDP1Q9P0J1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDP1Q9P0J1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDP1Q9P0J1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDP1Q9P0J1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDP1Q9P0J1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDP1Q9P0J1 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms