Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC8Q9H0W5 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms