Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW5

COG8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG8Q96MW5 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
COG8Q96MW5 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms