Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC7Q96M83 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms