Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM227BQ96M60 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms