Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.162e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.162e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.162e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.162e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.162e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.172e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PRDM16-210ENST00000607632 581 ntTSL 214□□□□□ -0.172e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RNF4-202ENST00000502316 855 ntTSL 213.99□□□□□ -0.172e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 STAM-201ENST00000377500 729 ntTSL 513.99□□□□□ -0.172e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 JUP-211ENST00000589036 566 ntTSL 413.99□□□□□ -0.172e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 NPEPPS-208ENST00000527298 1569 ntTSL 1 (best)13.99□□□□□ -0.172e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.172e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.172e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 GFM2-205ENST00000506778 566 ntTSL 413.98□□□□□ -0.172e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SERGEF-216ENST00000531299 440 ntTSL 213.97□□□□□ -0.172e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PLEKHB1-217ENST00000543524 656 ntTSL 413.97□□□□□ -0.172e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.172e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PAF1-202ENST00000416728 1383 ntTSL 213.96□□□□□ -0.172e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.172e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.172e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.172e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.182e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.182e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.182e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.182e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RAD52-208ENST00000481052 2464 ntTSL 213.93□□□□□ -0.182e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 IRF2-207ENST00000509274 591 ntTSL 413.93□□□□□ -0.182e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 USP15-206ENST00000546718 559 ntTSL 213.93□□□□□ -0.182e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.182e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MECR-204ENST00000463052 906 ntTSL 313.92□□□□□ -0.182e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.182e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.182e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.182e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SLC4A7-209ENST00000438530 3825 ntTSL 1 (best)13.91□□□□□ -0.182e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SH3BP2-226ENST00000513095 609 ntTSL 413.91□□□□□ -0.182e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.182e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MYO1D-202ENST00000394649 5451 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.182e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.192e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.192e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.192e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 HSD17B12-205ENST00000527433 559 ntTSL 413.88□□□□□ -0.192e-8■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.192e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.192e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 BIVM-ERCC5-205ENST00000639435 5632 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.195e-12■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.192e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 KMT5B-212ENST00000466295 638 ntTSL 213.87□□□□□ -0.192e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.194e-7■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.192e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SART3-208ENST00000547528 1935 ntTSL 1 (best)13.86□□□□□ -0.192e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.192e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MZT2B-205ENST00000457492 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 513.86□□□□□ -0.192e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PPHLN1-219ENST00000552202 1290 ntTSL 1 (best)13.85□□□□□ -0.192e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MEMO1-209ENST00000490459 1242 ntTSL 213.85□□□□□ -0.191e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ARFGAP2-224ENST00000531750 649 ntTSL 413.85□□□□□ -0.192e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ARFGAP2-206ENST00000525314 785 ntTSL 313.85□□□□□ -0.192e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.22e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.22e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RAB8A-203ENST00000587156 554 ntTSL 213.82□□□□□ -0.22e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.22e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 AKTIP-203ENST00000561799 586 ntTSL 413.81□□□□□ -0.22e-6■■■■■ 54.9
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TBRG4Q969Z0 PAEP-203ENST00000371768 838 ntTSL 513.8□□□□□ -0.22e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.22e-6■■■■■ 54.9
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TBRG4Q969Z0 TMEM168-201ENST00000312814 7470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.22e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.212e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CAMK2G-210ENST00000472912 2629 ntTSL 213.76□□□□□ -0.212e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.212e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SPATA13-203ENST00000382108 8463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.212e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PML-209ENST00000562086 2232 ntTSL 1 (best)13.74□□□□□ -0.212e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 KANSL1-227ENST00000639467 677 ntTSL 513.74□□□□□ -0.212e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 KANSL1-235ENST00000640751 464 ntTSL 513.74□□□□□ -0.212e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.212e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.212e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PHYKPL-207ENST00000481436 2025 ntTSL 213.73□□□□□ -0.212e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.212e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.212e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.222e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 OGFOD1-208ENST00000568172 537 ntTSL 413.7□□□□□ -0.222e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.222e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.222e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.225e-12■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CMC2-205ENST00000562828 438 ntTSL 213.68□□□□□ -0.225e-12■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CMC2-211ENST00000565613 663 ntTSL 513.68□□□□□ -0.225e-12■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 NPEPPS-221ENST00000534691 548 ntTSL 513.68□□□□□ -0.222e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 NPEPPS-218ENST00000532729 711 ntTSL 313.68□□□□□ -0.222e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.222e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.222e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 POLR1C-209ENST00000512472 569 ntTSL 213.66□□□□□ -0.222e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.222e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SDK2-204ENST00000479356 5333 ntTSL 1 (best)13.66□□□□□ -0.222e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 LPCAT3-203ENST00000535479 2902 ntTSL 1 (best)13.65□□□□□ -0.222e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.232e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MMP25-AS1-201ENST00000570949 491 ntTSL 313.62□□□□□ -0.232e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.232e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 AHI1-205ENST00000457866 5549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.235e-7■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SLC4A7-215ENST00000457377 3600 ntTSL 1 (best)13.59□□□□□ -0.232e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.242e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SAFB2-210ENST00000591310 722 ntTSL 313.58□□□□□ -0.242e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 UBN1-202ENST00000396658 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.242e-6■■■■■ 54.9
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