Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI9

GATAD2B, Transcriptional repressor p66-beta, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2BQ8WXI9 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GATAD2BQ8WXI9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
GATAD2BQ8WXI9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GATAD2BQ8WXI9 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GATAD2BQ8WXI9 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GATAD2BQ8WXI9 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GATAD2BQ8WXI9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GATAD2BQ8WXI9 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GATAD2BQ8WXI9 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GATAD2BQ8WXI9 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GATAD2BQ8WXI9 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GATAD2BQ8WXI9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GATAD2BQ8WXI9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GATAD2BQ8WXI9 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GATAD2BQ8WXI9 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GATAD2BQ8WXI9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GATAD2BQ8WXI9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GATAD2BQ8WXI9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GATAD2BQ8WXI9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GATAD2BQ8WXI9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GATAD2BQ8WXI9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GATAD2BQ8WXI9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GATAD2BQ8WXI9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GATAD2BQ8WXI9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GATAD2BQ8WXI9 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GATAD2BQ8WXI9 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GATAD2BQ8WXI9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GATAD2BQ8WXI9 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GATAD2BQ8WXI9 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GATAD2BQ8WXI9 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GATAD2BQ8WXI9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GATAD2BQ8WXI9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GATAD2BQ8WXI9 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GATAD2BQ8WXI9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GATAD2BQ8WXI9 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GATAD2BQ8WXI9 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GATAD2BQ8WXI9 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GATAD2BQ8WXI9 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GATAD2BQ8WXI9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GATAD2BQ8WXI9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GATAD2BQ8WXI9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GATAD2BQ8WXI9 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GATAD2BQ8WXI9 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GATAD2BQ8WXI9 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GATAD2BQ8WXI9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GATAD2BQ8WXI9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GATAD2BQ8WXI9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GATAD2BQ8WXI9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GATAD2BQ8WXI9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GATAD2BQ8WXI9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GATAD2BQ8WXI9 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GATAD2BQ8WXI9 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GATAD2BQ8WXI9 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GATAD2BQ8WXI9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GATAD2BQ8WXI9 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GATAD2BQ8WXI9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GATAD2BQ8WXI9 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GATAD2BQ8WXI9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GATAD2BQ8WXI9 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GATAD2BQ8WXI9 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GATAD2BQ8WXI9 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GATAD2BQ8WXI9 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GATAD2BQ8WXI9 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GATAD2BQ8WXI9 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GATAD2BQ8WXI9 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GATAD2BQ8WXI9 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GATAD2BQ8WXI9 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms