Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUQ0

CLVS1, Clavesin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1Q8IUQ0 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLVS1Q8IUQ0 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CLVS1Q8IUQ0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms