Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF550Q7Z398 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms