Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms