Protein–RNA interactions for Protein: Q6GMV2

SMYD5, SET and MYND domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD5Q6GMV2 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMYD5Q6GMV2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMYD5Q6GMV2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMYD5Q6GMV2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMYD5Q6GMV2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMYD5Q6GMV2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMYD5Q6GMV2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMYD5Q6GMV2 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMYD5Q6GMV2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMYD5Q6GMV2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SMYD5Q6GMV2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMYD5Q6GMV2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMYD5Q6GMV2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMYD5Q6GMV2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMYD5Q6GMV2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMYD5Q6GMV2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SMYD5Q6GMV2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SMYD5Q6GMV2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SMYD5Q6GMV2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms