Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms