Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDK4Q16654 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms