Protein–RNA interactions for Protein: Q13595

TRA2A, Transformer-2 protein homolog alpha, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TRA2AQ13595 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.296e-7■□□□□ 9.2
TRA2AQ13595 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.226e-7■□□□□ 9.2
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TRA2AQ13595 SPTAN1-215ENST00000628867 579 ntTSL 27.71□□□□□ -1.188e-6■□□□□ 9
TRA2AQ13595 RPL11-202ENST00000443624 994 ntTSL 27.6□□□□□ -1.198e-6■□□□□ 9
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TRA2AQ13595 SOS1-207ENST00000472480 396 ntTSL 53.07□□□□□ -1.928e-6■□□□□ 9
TRA2AQ13595 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.961e-6■□□□□ 9
TRA2AQ13595 SPAG9-218ENST00000514205 558 ntTSL 313.17□□□□□ -0.31e-6■□□□□ 9
TRA2AQ13595 SLTM-222ENST00000560494 674 ntTSL 311.94□□□□□ -0.53e-7■□□□□ 9
TRA2AQ13595 SLTM-209ENST00000493062 987 ntTSL 210.18□□□□□ -0.783e-7■□□□□ 9
TRA2AQ13595 DMXL2-201ENST00000251076 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.921e-6■□□□□ 9
TRA2AQ13595 AP3D1-208ENST00000590683 723 ntTSL 58.76□□□□□ -1.011e-6■□□□□ 9
TRA2AQ13595 SF1-218ENST00000489544 584 ntTSL 27.98□□□□□ -1.138e-8■□□□□ 9
TRA2AQ13595 SF1-217ENST00000486960 719 ntTSL 25.64□□□□□ -1.518e-8■□□□□ 9
TRA2AQ13595 OSBP-202ENST00000525357 991 ntTSL 1 (best)5.21□□□□□ -1.581e-6■□□□□ 9
TRA2AQ13595 HMGB1-207ENST00000468384 503 ntTSL 1 (best)5.07□□□□□ -1.61e-6■□□□□ 9
TRA2AQ13595 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.691e-6■□□□□ 9
TRA2AQ13595 DMXL2-213ENST00000560891 4759 ntTSL 1 (best)4.44□□□□□ -1.71e-6■□□□□ 9
TRA2AQ13595 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.81e-6■□□□□ 9
TRA2AQ13595 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.951e-6■□□□□ 9
TRA2AQ13595 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.073e-8■□□□□ 9
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