Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PKD2Q13563 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
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