Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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