Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERVK_113P63132 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HERVK_113P63132 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms