Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPS28P62857 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPS28P62857 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPS28P62857 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPS28P62857 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPS28P62857 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPS28P62857 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPS28P62857 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
RPS28P62857 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPS28P62857 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPS28P62857 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPS28P62857 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPS28P62857 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPS28P62857 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPS28P62857 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPS28P62857 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPS28P62857 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPS28P62857 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPS28P62857 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPS28P62857 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPS28P62857 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPS28P62857 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPS28P62857 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPS28P62857 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPS28P62857 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPS28P62857 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RPS28P62857 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPS28P62857 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPS28P62857 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPS28P62857 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPS28P62857 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPS28P62857 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPS28P62857 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPS28P62857 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPS28P62857 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPS28P62857 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPS28P62857 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPS28P62857 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPS28P62857 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPS28P62857 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPS28P62857 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPS28P62857 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPS28P62857 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPS28P62857 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPS28P62857 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPS28P62857 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPS28P62857 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPS28P62857 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPS28P62857 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPS28P62857 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPS28P62857 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPS28P62857 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPS28P62857 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPS28P62857 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPS28P62857 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPS28P62857 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPS28P62857 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPS28P62857 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPS28P62857 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPS28P62857 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPS28P62857 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPS28P62857 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPS28P62857 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPS28P62857 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPS28P62857 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPS28P62857 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPS28P62857 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPS28P62857 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPS28P62857 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPS28P62857 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPS28P62857 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPS28P62857 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPS28P62857 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPS28P62857 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPS28P62857 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPS28P62857 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPS28P62857 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPS28P62857 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPS28P62857 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPS28P62857 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPS28P62857 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPS28P62857 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPS28P62857 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPS28P62857 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS28P62857 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS28P62857 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS28P62857 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS28P62857 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS28P62857 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS28P62857 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS28P62857 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS28P62857 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS28P62857 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS28P62857 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS28P62857 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS28P62857 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS28P62857 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS28P62857 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS28P62857 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS28P62857 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms