Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms