Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms