Protein–RNA interactions for Protein: P51787

KCNQ1, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1P51787 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNQ1P51787 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNQ1P51787 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNQ1P51787 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNQ1P51787 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNQ1P51787 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNQ1P51787 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNQ1P51787 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNQ1P51787 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNQ1P51787 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNQ1P51787 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNQ1P51787 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNQ1P51787 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNQ1P51787 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNQ1P51787 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNQ1P51787 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNQ1P51787 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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