Protein–RNA interactions for Protein: P47211

GALR1, Galanin receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALR1P47211 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GALR1P47211 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GALR1P47211 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GALR1P47211 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GALR1P47211 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GALR1P47211 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GALR1P47211 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GALR1P47211 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GALR1P47211 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GALR1P47211 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GALR1P47211 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GALR1P47211 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GALR1P47211 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GALR1P47211 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GALR1P47211 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GALR1P47211 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GALR1P47211 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GALR1P47211 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GALR1P47211 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GALR1P47211 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GALR1P47211 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GALR1P47211 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GALR1P47211 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GALR1P47211 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GALR1P47211 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GALR1P47211 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GALR1P47211 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GALR1P47211 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GALR1P47211 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GALR1P47211 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GALR1P47211 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GALR1P47211 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GALR1P47211 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GALR1P47211 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GALR1P47211 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GALR1P47211 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GALR1P47211 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GALR1P47211 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GALR1P47211 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GALR1P47211 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GALR1P47211 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GALR1P47211 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GALR1P47211 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GALR1P47211 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GALR1P47211 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GALR1P47211 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GALR1P47211 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GALR1P47211 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GALR1P47211 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GALR1P47211 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GALR1P47211 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GALR1P47211 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GALR1P47211 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GALR1P47211 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GALR1P47211 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GALR1P47211 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GALR1P47211 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GALR1P47211 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GALR1P47211 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GALR1P47211 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GALR1P47211 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GALR1P47211 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GALR1P47211 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GALR1P47211 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GALR1P47211 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GALR1P47211 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GALR1P47211 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GALR1P47211 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GALR1P47211 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GALR1P47211 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GALR1P47211 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GALR1P47211 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GALR1P47211 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GALR1P47211 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GALR1P47211 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GALR1P47211 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GALR1P47211 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GALR1P47211 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GALR1P47211 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GALR1P47211 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GALR1P47211 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GALR1P47211 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GALR1P47211 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GALR1P47211 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GALR1P47211 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GALR1P47211 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GALR1P47211 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GALR1P47211 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GALR1P47211 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GALR1P47211 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GALR1P47211 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GALR1P47211 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GALR1P47211 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GALR1P47211 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GALR1P47211 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GALR1P47211 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GALR1P47211 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GALR1P47211 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GALR1P47211 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GALR1P47211 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms