Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MDH1P40925 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MDH1P40925 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MDH1P40925 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MDH1P40925 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MDH1P40925 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MDH1P40925 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MDH1P40925 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MDH1P40925 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MDH1P40925 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MDH1P40925 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MDH1P40925 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MDH1P40925 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MDH1P40925 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MDH1P40925 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MDH1P40925 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MDH1P40925 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MDH1P40925 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MDH1P40925 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MDH1P40925 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MDH1P40925 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MDH1P40925 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MDH1P40925 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MDH1P40925 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MDH1P40925 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MDH1P40925 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MDH1P40925 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MDH1P40925 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MDH1P40925 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MDH1P40925 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MDH1P40925 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MDH1P40925 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MDH1P40925 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MDH1P40925 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MDH1P40925 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MDH1P40925 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MDH1P40925 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MDH1P40925 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MDH1P40925 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MDH1P40925 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MDH1P40925 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MDH1P40925 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MDH1P40925 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MDH1P40925 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MDH1P40925 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MDH1P40925 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MDH1P40925 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MDH1P40925 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MDH1P40925 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MDH1P40925 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MDH1P40925 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MDH1P40925 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MDH1P40925 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MDH1P40925 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MDH1P40925 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MDH1P40925 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MDH1P40925 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MDH1P40925 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MDH1P40925 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MDH1P40925 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MDH1P40925 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MDH1P40925 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MDH1P40925 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MDH1P40925 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MDH1P40925 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MDH1P40925 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MDH1P40925 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MDH1P40925 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MDH1P40925 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MDH1P40925 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MDH1P40925 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MDH1P40925 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MDH1P40925 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MDH1P40925 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MDH1P40925 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MDH1P40925 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MDH1P40925 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MDH1P40925 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MDH1P40925 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MDH1P40925 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MDH1P40925 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MDH1P40925 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MDH1P40925 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MDH1P40925 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MDH1P40925 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MDH1P40925 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MDH1P40925 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MDH1P40925 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MDH1P40925 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MDH1P40925 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MDH1P40925 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MDH1P40925 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MDH1P40925 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MDH1P40925 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MDH1P40925 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MDH1P40925 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MDH1P40925 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MDH1P40925 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
MDH1P40925 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MDH1P40925 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms