Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB5AP20339 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms