Protein–RNA interactions for Protein: O75113

N4BP1, NEDD4-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP1O75113 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
N4BP1O75113 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
N4BP1O75113 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
N4BP1O75113 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
N4BP1O75113 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
N4BP1O75113 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
N4BP1O75113 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
N4BP1O75113 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
N4BP1O75113 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
N4BP1O75113 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
N4BP1O75113 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
N4BP1O75113 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
N4BP1O75113 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
N4BP1O75113 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
N4BP1O75113 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
N4BP1O75113 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
N4BP1O75113 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
N4BP1O75113 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
N4BP1O75113 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms