Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms