Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1G8

TRBV10-2, T-cell receptor beta variable 10-2 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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TRBV10-2A0A0K0K1G8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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TRBV10-2A0A0K0K1G8 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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TRBV10-2A0A0K0K1G8 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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TRBV10-2A0A0K0K1G8 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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TRBV10-2A0A0K0K1G8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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TRBV10-2A0A0K0K1G8 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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TRBV10-2A0A0K0K1G8 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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TRBV10-2A0A0K0K1G8 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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TRBV10-2A0A0K0K1G8 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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TRBV10-2A0A0K0K1G8 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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TRBV10-2A0A0K0K1G8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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