Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.014e-8■■□□□ 11.4
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PRPF8Q6P2Q9 R3HDM2-202ENST00000358907 3974 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.092e-7■■□□□ 11.4
PRPF8Q6P2Q9 SDC2-207ENST00000522911 677 ntTSL 3 BASIC8.2□□□□□ -1.12e-7■■□□□ 11.4
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PRPF8Q6P2Q9 ZFYVE26-209ENST00000557306 1533 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.192e-7■■□□□ 11.4
PRPF8Q6P2Q9 CS-209ENST00000547449 434 ntTSL 27.55□□□□□ -1.22e-7■■□□□ 11.4
PRPF8Q6P2Q9 LAMB1-210ENST00000474380 945 ntTSL 57.5□□□□□ -1.212e-6■■□□□ 11.4
PRPF8Q6P2Q9 NAV2-207ENST00000526675 607 ntTSL 57.43□□□□□ -1.222e-7■■□□□ 11.4
PRPF8Q6P2Q9 CNOT4-203ENST00000361528 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.232e-7■■□□□ 11.4
PRPF8Q6P2Q9 ZC3H11A-207ENST00000461980 822 ntTSL 27.15□□□□□ -1.262e-10■■□□□ 11.4
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PRPF8Q6P2Q9 ZC3H11A-211ENST00000492823 447 ntTSL 37.09□□□□□ -1.272e-10■■□□□ 11.4
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