Protein–RNA interactions for Protein: V9GYV3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYV3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
V9GYV3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
V9GYV3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
V9GYV3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
V9GYV3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
V9GYV3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
V9GYV3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
V9GYV3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
V9GYV3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
V9GYV3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
V9GYV3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
V9GYV3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
V9GYV3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
V9GYV3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
V9GYV3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
V9GYV3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
V9GYV3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
V9GYV3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
V9GYV3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
V9GYV3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
V9GYV3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
V9GYV3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
V9GYV3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
V9GYV3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
V9GYV3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
V9GYV3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
V9GYV3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
V9GYV3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
V9GYV3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
V9GYV3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
V9GYV3 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
V9GYV3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GYV3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GYV3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GYV3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GYV3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GYV3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GYV3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GYV3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GYV3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GYV3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GYV3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GYV3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GYV3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GYV3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GYV3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GYV3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GYV3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GYV3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GYV3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GYV3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GYV3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GYV3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GYV3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GYV3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GYV3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GYV3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GYV3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GYV3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GYV3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GYV3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GYV3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GYV3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GYV3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GYV3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GYV3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GYV3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GYV3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GYV3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GYV3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GYV3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GYV3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GYV3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GYV3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GYV3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GYV3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GYV3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
V9GYV3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
V9GYV3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
V9GYV3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
V9GYV3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
V9GYV3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
V9GYV3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
V9GYV3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
V9GYV3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
V9GYV3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
V9GYV3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
V9GYV3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
V9GYV3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
V9GYV3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
V9GYV3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
V9GYV3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
V9GYV3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
V9GYV3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
V9GYV3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
V9GYV3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
V9GYV3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.08■□□□□ 0
V9GYV3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
V9GYV3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
V9GYV3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms