Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GTF3C3Q9Y5Q9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms